北門潟湖從北門海埔新生地延伸到馬沙溝，介於王爺港汕、青山港汕與內陸之間，長約6公里，寬約2公里，是倒風內海僅存的殘跡，因溼地堆積作用旺盛，所以此處蘊含豐富的生態與水產資源，產量不少的野生蚵、赤嘴仔、蝦蟹與文蛤等。

七股鹽田濕地位於台南縣七股鄉，是目前台灣最大的潟湖，也是台江內海最後遺留，七股漁民稱為「內海仔」。潟湖優良的生態環境，孕育了豐富的海洋生物，再加上人工養殖的魚塭，提供了黑面琵鷺等過境鳥類的食物來源，是牠們的最佳棲息地。

濕地保育的方式，除了加強保護現有未經破壞的自然濕地、劃設保護區外，濕地復育與再生，也是經常採行的辦法，有鑑於濕地防澇滯洪、淨化汙水、涵養水源、孕育物種的種種功能，主動經營、創造濕地，更是目前世界當前的趨勢。美國舊金山南灣鹽田的復育案例，就是一個透過人力介入要求傳統產業退位，讓濕地再生的經典案例。