車子由臺17線轉進南38線，車外的景觀逐漸由甘蔗田轉換成漁塭，成群的鷺鷥出現在漁塭水岸旁，不時嘎嘎鳴叫，似乎在歡迎著遠道而來的遊客。這裡是臺南七股，黑面琵鷺在臺灣最主要的度冬地。為加強黑面琵鷺的保育，農委會先於2002年10月將此地劃定為野生動物重要棲息環境；臺南縣政府並旋即於半個月後公告成立「曾文溪口北岸黑面琵鷺野生動物保護區」，並在農委會的經費支持下，陸續改善賞鳥設施並籌設黑面琵鷺保育暨研究中心。

當你走在紅樹林自然保留區的木棧道上，放眼望去盡是綠意盎然，裸露的泥灘地上彈塗魚爬跳、招潮蟹橫行，河口溼地生態一覽無遺。但就隔著一片綠海，同時也看到周邊林立的高樓大廈，與茂密的紅樹林生態形成強烈的對比。這片水筆仔純林，成為都會中一處難得的綠洲。

淡水河在過了關渡後，河道逐漸變寬；過了淡水竹圍地區後則向左岸形成一個大彎。由於河水流速減緩，從上游沖刷而下的泥沙淤積在河道的凹處，漸漸形成沙洲沼澤區。這片沙洲緊貼著河岸，在漲潮時有三分之二區域浸在水中，但在退潮時與陸地間形成一條明顯水道。這個北寬南窄如肝臟的沙洲，就是淡水河紅樹林自然保留區所在區域。由於距離出海口僅5公里，因潮水漲退，淡鹹水混合，鹽度變化大，這獨特的環境成為水筆仔生長的絕佳場域。

早期無尾港周邊是個傳統漁村，附近陸地原有部分水田及旱田，但因溼地聚集大量鳥類棲息，農業生產受鳥類嚴重干擾，只好放棄耕作，現在只剩少量的番薯、花生與蘿蔔栽植。隨著近海漁業資源的枯竭，海上漁業逐漸式微，年輕一代漁民生活無以為繼，又正逢臺灣工商業蓬勃的年代，於是漁村青年紛紛外出轉行謀生，使得聚落更顯老化與凋敝。

宜蘭縣蘇澳鎮的「無尾港」，原為清朝《噶瑪蘭廳志》中所記載的「馬賽港」，1942年受颱風影響，新城溪河道北移以致溪水漸稀，後來又在1968年的風災中造成嚴重的土石流，致使河口完全淤積不通，逐漸形成一片自然沼澤溼地，各種溼地植物叢生，大量落葉堆積形成豐富的腐植質，吸引多種水生昆蟲、魚類及甲殼類動物聚集，也提供了鳥類棲息環境及食物來源。

鰲鼓溼地最早是由北港溪和朴子溪出海口的泥沙所淤積而成的沙洲，日治時代曾在此設置鰲鼓農場進行囤墾。自國民政府來臺，曾將此地移為空軍訓練用靶場；而臺糖公司則於60年代開始在今溼地內大興土木，早期曾動用犯人兵進行圍堤填海造陸，將這塊泥灘地開發成海埔新生地，稱之為「東石農場」，以經營養豬、畜牧、養魚、甘蔗種植等事業。鄰近許多村落居民亦來到東石農場從事勞力工，臺糖也在此興建宿舍。隨著一間間草寮與工寮搭起，逐漸吸引更多人前來做生意定居。在全盛時期，海尾寮（今四股社區）路口曾經是熱鬧的大市集，晚上甚至有賣膏藥